École chercheur internationale en écotoxicologie microbienne

L’école chercheur « Functional Experimental Approaches in Microbial Ecotoxicology: Bridging the Gap from Field to Lab » a proposé en Octobre 2025 une formation de 4 jours dédiée aux mesures fonctionnelles en microbiologie environnementale appliquée à l’écotoxicologie en alliant cours théoriques et applications pratiques sur le terrain ainsi qu’au laboratoire. Cette école internationale, organisée par le réseau d’écotoxicologie microbienne Ecotoxicomic et la fondation Evertea, a réuni 16 participant·e·s venant de 7 pays différents. Cette formation mettait l’accent sur une approche pratique permettant aux participant·e·s de réaliser eux-même prélèvements et analyses au laboratoire, cette approche pratique a largement bénéficié des infrastructures AnaEE.

Les approches terrain ont notamment bénéficié du Lab-Mobile (installation Biochem-Env, INRAE) permettant aux participant·e·s d’étudier des échantillons de sol en allant du prélèvement à l’analyse d’activités enzymatiques in situ.

Prélèvement et analyse de sol avec le lab-mobile (Biochem-Env, INRAE), école chercheur Ecotoxicomic 2025. Crédit photo: C. Bonnineau

Les travaux pratiques ont eu lieu au laboratoire XPO-Plateforme d'expérimentation et d'observation sur les écosystèmes aquatiques (UR EABX, INRAE). Les participant·e·s ont pu prélever des communautés microbiennes de différents types de mésocosmes notamment de canaux simulant une rivière pour l’étude du périphyton et de mésocosmes simulant les marées pour l’étude du sédiment côtier. Des analyses fonctionnelles ont ensuite été réalisées sur ces échantillons incluant notamment des mesures d’activité photosynthétique, des suivis de production et consommation d’O2 pour déterminer la production primaire, des mesures d’activités enzymatiques hétérotrophes impliquées dans le cycle du C…

Prélèvement en mésocosmes et analyse fonctionnelle de communautés microbiennes aquatiques au laboratoire XPO-Plateforme d'expérimentation et d'observation sur les écosystèmes aquatiques (UR EABX, INRAE), école chercheur Ecotoxicomic 2025. Crédit photo: C. Bonnineau, L. Kergoat



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