L'infrastructure AnaEE-France est constituée de cinq piliers, assurant des fonctions complémentaires dans le domaine de la recherche sur les écosystèmes continentaux :

  1. Les plateformes d'expérimentation en milieu contrôlé, permise par les Ecotrons
  2. Les plateformes d'expérimentation en milieu semi-contrôlé
  3. Les plateformes d'expérimentation In Natura
  4. Les plateformes analytiques, incluant :
  5. Les plateformes de modélisation et de gestion des données.