EcogenO

EcogenO

Présentation

La plateforme EcogenO est spécialisée dans la génomique environnementale et vous accompagne dans tous vos projets de recherche. Nous réalisons des projets de production d’amplicons (16S, 18S, ITS...) à grande échelle et leur analyse par séquençage ainsi des projets de RNASeq ou encore DNASeq.

Dotée de séquenceurs NGS (Next-Generation Sequencing) moyen et haut-débit et d'un grand nombre d'équipements satellites nécessaires à la préparation des échantillons, la plate-forme EcogenO peut intervenir de la préparation des librairies par automatisation jusqu'à l'analyse primaire bio-informatique des données.

De plus, la présence sur la plate-forme EcogenO d’un équipement de PCR quantitative très haut débit, unique en France (Smartchip system, Takara), nous permet de vous proposer des prestations de qPCR haut-débit et génotypage SNP. Nous proposons également la détection de gènes d'antibiorésistance grâce à un catalogue de 384 marqueurs à disposition.

EcogenO dispose d’une grande capacité de stockage et d’analyses des données NGS permettant de développer des analyses bio-informatiques, spécifiques à un projet ou une application sur un mode collaboratif.

Certains des équipements que nous possédons sont mis à disposition de la communauté scientifique après formation et habilitation par le personnel, vous permettant de gérer facilement de gros projets par vous-même.