La plate-forme EcogenO, spécialisée dans la génomique environnementale, offre des réflexions originales et promeut le transfert de connaissances et de savoir-faire dans le domaine.
Cette plate-forme permet de réaliser des projets de production d’amplicons à grande échelle et leur analyse par séquençage, des projets de RNASeq, ChipSeq ou encore DNASeq...
Dotée de séquenceurs NGS de 2ème génération (Illumina) et d'un grand nombre d'équipements satellites nécessaires à la préparation des échantillons, la plate-forme EcogenO propose la réalisation et l'accompagnement dans les projets de séquençage, de la préparation des librairies jusqu'à l'analyse primaire bio-informatique des données.
De plus, la présence sur la plate-forme EcogenO d’un équipement de PCR quantitative et de génotypage très haut débit, unique en France (Smartchip system, Takara), offre à la communauté scientifique une capacité de conduite de projet pour des analyses fonctionnelles (qPCR et RT-qPCR, dPCR) et du génotypage SNP.
EcogenO dispose d’une grande capacité de stockage et d’analyses des données NGS permettant de développer des analyses bio-informatiques, spécifiques à un projet ou une application sur un mode collaboratif.
Certains de ces équipements sont mis à disposition de la communauté scientifique à proximité de la plate-forme, après formation et habilitation par le personnel.
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Localisation
Plateforme EcogenO (Campus de Beaulieu)
Université de Rennes 1 - Campus de Beaulieu
CNRS – OSUR Bat. 14A - Bureau 037
263 avenue du Général Leclerc
35042 RENNES Cedex
France
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