Les microcosmes aquatiques sont de petits conteneurs consacrés aux études d’écosystèmes microbiens aquatiques de populations isolées à des communautés de bactéries, de microalgues et d’autres organismes planctoniques. Actuellement, les laboratoires dédiés mettent à disposition 13 chémostats simples pour la culture des bactéries et du phytoplancton dans des conditions stériles et 4 chémostats doubles (système jumelé composé de deux chémostats simples) dédié à l’étude des interactions entre phytoplancton et zooplancton.
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